Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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Ccl20O89093 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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Ccl20O89093 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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Ccl20O89093 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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Ccl20O89093 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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