Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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MttpO08601 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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MttpO08601 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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MttpO08601 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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MttpO08601 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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MttpO08601 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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MttpO08601 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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MttpO08601 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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MttpO08601 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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MttpO08601 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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MttpO08601 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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MttpO08601 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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MttpO08601 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MttpO08601 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MttpO08601 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MttpO08601 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MttpO08601 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MttpO08601 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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