Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms