Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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Col5a3Q9JLI2 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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Col5a3Q9JLI2 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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Col5a3Q9JLI2 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
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