Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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