Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim12aQ99PQ1 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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Trim12aQ99PQ1 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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Trim12aQ99PQ1 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim12aQ99PQ1 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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