Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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Amigo1Q80ZD8 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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Amigo1Q80ZD8 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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Amigo1Q80ZD8 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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Amigo1Q80ZD8 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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Amigo1Q80ZD8 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Amigo1Q80ZD8 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Amigo1Q80ZD8 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Amigo1Q80ZD8 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Amigo1Q80ZD8 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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