Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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PtprjQ64455 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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PtprjQ64455 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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PtprjQ64455 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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PtprjQ64455 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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PtprjQ64455 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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PtprjQ64455 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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PtprjQ64455 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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PtprjQ64455 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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PtprjQ64455 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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PtprjQ64455 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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PtprjQ64455 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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PtprjQ64455 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprjQ64455 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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