Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms