Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rpusd2Q149F1 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rpusd2Q149F1 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rpusd2Q149F1 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rpusd2Q149F1 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rpusd2Q149F1 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpusd2Q149F1 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms