Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Irx1P81068 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms