Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd13P70217 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms