Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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Ccl20O89093 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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Ccl20O89093 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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