Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rabgef1Q9JM13 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rabgef1Q9JM13 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Rabgef1Q9JM13 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Rabgef1Q9JM13 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Rabgef1Q9JM13 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Rabgef1Q9JM13 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Rabgef1Q9JM13 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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Rabgef1Q9JM13 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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