Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms