Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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