Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf144aQ925F3 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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