Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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