Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms