Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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