Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VdrP48281 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms