Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtprmP28828 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprmP28828 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms