Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RxraP28700 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RxraP28700 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RxraP28700 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms