Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd10P28359 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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Hoxd10P28359 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Hoxd10P28359 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Hoxd10P28359 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Hoxd10P28359 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Hoxd10P28359 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Hoxd10P28359 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd10P28359 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms