Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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Hoxd9P28357 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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Hoxd9P28357 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
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Hoxd9P28357 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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