Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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Ccl20O89093 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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Ccl20O89093 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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Ccl20O89093 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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