Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms