Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cib2Q9Z309 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms