Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms