Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms