Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms