Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd4Q9Z2D7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms