Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip6Q9Z1Y4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip6Q9Z1Y4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip6Q9Z1Y4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trip6Q9Z1Y4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trip6Q9Z1Y4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trip6Q9Z1Y4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip6Q9Z1Y4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms