Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms