Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr5Q9Z1P4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms