Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms