Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms