Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms