Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms