Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup160Q9Z0W3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms