Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Oc90Q9Z0L3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oc90Q9Z0L3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms