Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms