Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms