Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUS4

Gja10, Gap junction alpha-10 protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja10Q9WUS4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja10Q9WUS4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja10Q9WUS4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms