Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lemd3Q9WU40 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms