Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV7

Rlim, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlimQ9WTV7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RlimQ9WTV7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms