Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TapbpQ9R233 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms