Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hic1Q9R1Y5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hic1Q9R1Y5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hic1Q9R1Y5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hic1Q9R1Y5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms