Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms