Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx6Q9R1R0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms